niche集群细胞？ 细胞聚集体？

干细胞如何维持自我更新

1、转录因子的调控：在胚胎干细胞中，OctSox2和Nanog等转录因子在干细胞自我更新过程中起重要作用。它们能够维持干细胞的干性，同时抑制促进分化基因的表达。这些转录因子所调控的基因网络，共同维持了干细胞的自我更新能力。

2、胚胎干细胞通过全能性维持自我更新：就像小小的魔术师一样，胚胎干细胞在囊胚阶段就拥有了变成身体里任何一种细胞的魔力，它们可以不断地自我复制，保持自己的“魔力”不变，随时准备分化成我们需要的各种细胞。成体干细胞在特定条件下更新或分化：成年后，我们的身体里也有一些“超级英雄”——成体干细胞。

3、当受精卵分裂发育成囊胚时，内层细胞团的细胞即为胚胎干细胞。胚胎干细胞具有全能性，可以自我更新并具有分化为体内所有组织的能力； 成年动物的许多组织和器官，比如表皮和造血系统，具有修复和再生的能力。成体干细胞在其中起着关键的作用。

4、细胞周期调控 干细胞通过精确的细胞周期调控来确保DNA的适当复制和细胞分裂，这是维持干细胞池的重要过程。细胞周期调控蛋白如Cyclin和CDK（周期蛋白依赖性激酶）的活性和表达模式在干细胞中尤为关键。信号通路 多种信号通路，如Wnt、TGF-β和Hh（音猬因子）等，在干细胞自我更新中起调控作用。

5、自我更新确保了干细胞保持多向分化的能力，对于组织特异性干细胞而言，自我更新是其维持终生分化潜能的关键机制。以骨骼肌干细胞为例，这些细胞主要负责骨骼肌的修复工作。当骨骼肌组织受损时，干细胞会被激活，从静息状态中苏醒，随后经过一系列过程分化为新的肌纤维，补充受损的组织。

6、干细胞生成背后有复杂原理。干细胞具有自我更新和分化的能力。自我更新时，干细胞通过细胞分裂产生与自身相同的细胞，维持干细胞池的稳定，以持续为机体提供细胞来源。在分化方面，受到多种信号通路和微环境因素的调控。

洪登礼贡献

1、洪登礼在科学研究领域做出了显著的贡献，他的研究主要聚焦于干细胞在生理和病理性niche中的关键作用，以及这些细胞的基因组稳定性与克隆性演化。他的研究成果在国际知名期刊上得到了广泛的认同，其中包括在Science、cell Stem Cell和JCI等顶级科学杂志上发表的论文。

2、洪登礼，男，汉族，湖北省阳新县人，毕业于原同济医科大学医疗系。1995年在华中科技大学同济医学院攻读硕士、博士学位，后留学于意大利研究干细胞，2003年至2009在牛津大学从事“前白血病干细胞”概念的研究工作。

3、洪登礼的研究在多个领域有着显著贡献，特别是在血液学和干细胞生物学方面。他的学术论文深入探讨了不同基因融合对细胞功能的影响，以及这些影响在疾病发生和发展中的作用。

4、科学家洪登礼、军事家和外交家伍修权、教育家刘湛恩等也贡献卓越。此外，还有歌唱家曹燕珍、作曲家李家高、戏曲理论家郑传寅等艺术家，以及经济学家夏道平、中国科学院院士孔祥复等专家学者。在古代，黄石也有着辉煌的历史，清朝时期抗俄御日的江自康将军、一品振威将军敖天印等都展现了英勇。

单细胞分析之细胞交互-5:NicheNet多组间互作比较

之前写过 NicheNet 的标准分析pipeline，实际上做细胞互作分析的时候我们更多的还是在做样本间的互作差异比较。平常我用CellChat比较多，但其实NicheNet也可以做多样本互作比较，而且效果更好。加载所需要的包 读入演示数据 这个演示里面比较的是pEMT-high-niche和pEMT-low-niche，换成不同组都一样的。

单细胞多样本整合：merge（）；多样本拆分：SplitObject（） 1 在做多组数据整合，每个组又有多个样本的时候，最好把单独的每个样本当成批次，而不是把不同的组当成批次。 1 多核运算 参考： 单细胞数据分析中future包的使用 1 pbmc3k.final@commands$FindClusters 可以查看FindClusters运行时间和记录。

今日与您分享一款名为NeuronChat的软件，这是一款专门针对神经细胞通讯信号预测的工具。在进行单细胞转录组分析时，CellChat、CellPhoneDB、NicheNet等软件已广为使用，但在特定组织或细胞类别分析中，您可能遇到分析得到的配受体对不够或不足以表达想说明的生物学意义的问题。

LIANA（LIgand-receptor AAnalysis frAmework）是一个框架，能够使用不同的资源和方法对来自单细胞转录组学的配体-受体相互作用进行优先排序。 它允许用户系统地生成关于来自给定细胞类型的哪些配体与另一种细胞类型的受体结合的假设。